О разработке прототипа ДНК-биочипа для параллельной индикации актуальных возбудителей внебольничных пневмоний
19  07.2021
В институте начаты исследования, посвященные разработке прототипа ДНК-биочипа для параллельной индикации актуальных возбудителей внебольничных пневмоний, в том числе нового коронавируса SARS-CoV-2.
Об изучении противовирусной активности отдельных пробиотических штаммов лакто- и бифидобактерий
19  07.2021
Учеными ФБУН ННИИЭМ им.академика И.Н.Блохиной Роспотребнадзора была изучена противовирусная активность шести производственных пробиотических штаммов.

Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования

Главная  »  Новости  »  Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
Версия для печати
Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
24  11.2017
На базе сервера института развернута система, позволяющая проводить анализ результатов полногеномного секвенирования (NGS). Сервис доступен всем желающим.

Система "EDGE bioinformatics" (Los Alamos National Security) позволяет проводить типовой анализ результатов секвенирования (NGS) без необходимости привлечения высококвалифицированного специалиста в области биоинформатики.

Система позволяет проводить следущие виды анализа:

  • контролировать качество чтений
  • собирать геном de novo
  • аннотировать геномы
  • выравнивать чтения на референсную последовательность
  • строить филогенетические деревья
  • проводить таксономическую классификацию метагеномных образцов
  • выявлять факторы вирулентности и антибиотикорезистентности патогенов

На сегодняшний день система "EDGE bioinformatics" развернута на базе сервера инстиута. Использование системы доступно всем пользователям после регистрации (по запросу на адрес solntsev.l.a@nniiem.ru).

Перейти на сервис "EDGE bioinformatics"

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
RUS | ENG
(831) 469-79-01
События