On-line семинар-конференция "Масс-спектрометрия и перспективы ее применения в области микробиологии  и эпидемиологии"
20  09.2019
20 сентября состоялся on-line семинар-конференция "Масс-спектрометрия и перспективы ее применения в области микробиологии и эпидемиологии", организованный Советами молодых ученых и специалистов семи научных учреждений Роспотребнадзора.
Итоги Конкурса научных докладов молодых ученых
16  09.2019
12 сентября в рамках Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Научное обеспечение противоэпидемической защиты населения: актуальные проблемы и решения», посвященной 100-летию ФБУН ННИИЭМ им.академика И.Н.Блохиной Роспотребнадзора, прошел Конкурс докладов молодых ученых.

Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования

Главная  »  Новости  »  Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
Версия для печати
Новый сервис для анализа результатов полногеномного секвенирования
24  11.2017
На базе сервера института развернута система, позволяющая проводить анализ результатов полногеномного секвенирования (NGS). Сервис доступен всем желающим.

Система "EDGE bioinformatics" (Los Alamos National Security) позволяет проводить типовой анализ результатов секвенирования (NGS) без необходимости привлечения высококвалифицированного специалиста в области биоинформатики.

Система позволяет проводить следущие виды анализа:

  • контролировать качество чтений
  • собирать геном de novo
  • аннотировать геномы
  • выравнивать чтения на референсную последовательность
  • строить филогенетические деревья
  • проводить таксономическую классификацию метагеномных образцов
  • выявлять факторы вирулентности и антибиотикорезистентности патогенов

На сегодняшний день система "EDGE bioinformatics" развернута на базе сервера инстиута. Использование системы доступно всем пользователям после регистрации (по запросу на адрес solntsev.l.a@nniiem.ru).

Перейти на сервис "EDGE bioinformatics"

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
RUS | ENG
(831) 469-79-01
События