Work during the NCI pandemic

Организация лабораторных исследований и мониторинг COVID-19 во ФБУН ННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора в период пандемии

Специалисты научных лабораторий института, на основе функционирующих на их базе научно-методических центров (включая Региональный научно методический центр по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней II–IV групп патогенности ПФО), оказывали консультативную и практическую помощь органам здравоохранения и учреждениям Роспотребнадзора в оценке эпидситуации по заболеваемости COVID-19, проведении и совершенствовании лабораторной диагностики SARS-CoV-2, выполняли экспертно-диагностические, скрининговые и верификационные исследования. 

Для оказания помощи практическому здравоохранению Нижегородской области Институт временно передал здание своего структурного подразделения – Клиники инфекционных болезней в распоряжение ГБУЗНО «Инфекционная больница № 2» для расширения коечного фонда и оказания медицинской помощи больным коронавирусной инфекцией, в том числе силами врачей, среднего и младшего медицинского персонала Института.

В период с 29.01.2020 г. по 29.03.2020 г. институтом была оказана практическая и консультативно-методическая помощь ФБУЗ ЦГиЭ девяти субъектов ПФО (Кировская, Ульяновская, Пензенская, Нижегородская области, Республики Татарстан, Марий Эл, Мордовия, Чувашская Республика, Удмуртская Республика), а также Ивановской области и Республики Коми. Проведена ПЦР-диагностика 742 образцов клинического материала от 403 человек с отрицательным результатом. Впервые РНК SARS-CoV-2 была обнаружена 30.03.2020 г. в образце респираторного мазка от пациента с внебольничной пневмонией, поступившего из ФБУЗ «ЦГиЭ в Ивановской области».

Сотрудниками Института была оказана практическая помощь 24 учреждениям здравоохранения г. Нижнего Новгорода (ГБУЗ НО «ГКБ № 3», «ГКБ № 10», «ГКБ № 12», «ГКБ № 28», «ГКБ № 30», «ГКБ № 33», «ГКБ № 38», «ГКБ № 39», «ГКБ им. Семашко», ПОМЦ, НОДКБ и др.) по проведению диагностических исследований респираторных мазков от 930 пациентов с диагнозом «Внебольничная пневмония». У 240 (25,8 %) пациентов была обнаружена РНК коронавируса SARS-CoV-2.

По запросу Управления Роспотребнадзора по Нижегородской области (от 03.06.2020 г. №52-00-08/09-4491-2020) с 05.06.2020 г. институт выполнял  верификационные исследования для диагностических лабораторий г. Нижнего Новгорода и Нижегородской области, проводящих скрининговые ПЦР-исследования на COVID-19. Всего с данной целью  было исследовано 6693 респираторных мазков от пациентов различных медицинских организаций.

Подготовка методических материалов

В целях обеспечения качества лабораторных исследований по верификации возбудителя COVID-19 и оперативного получения достоверных результатов сотрудниками института проведена большая работа по подготовке различных методических писем и инструкций по стандартизации долабораторного этапа диагностики. Подготовленные материалы по соблюдению требований преаналитического этапа исследований с подробным описанием алгоритма взятия респираторных мазков, хранения и доставки биоматериала были разосланы Управлениям Роспотребнадзора и ФБУЗ ЦГиЭ и учреждениям здравоохранения субъектов ПФО, ФБУЗ ЦГиЭ в Республике Коми, Управлению Роспотребнадзора по Ивановской области, Департаменту здравоохранения Ивановской области (от 28.01.2020 г. № 152-50-02/08-66-2020; от 30.03.20 г № 152-50-02/08-344-2020; от 26.04.20 г № 152-50-04/08-547-2020; от 27.04.20 г. № 152-50-04/08-562-2020; от 03.05.20 г. № 152-50-04/08-602-2020; от 05.05.20 г. № 152-50-04/08-610-2020; от 07.05.20 г. № 152-50-04/08-633-2020; от 12.05.20 г. № 152-50-04/08-659-2020; от 18.05.20 г. № 152-50-04/08-687-2020).

Подготовка кадров. Образовательный компонент в системе эпидемиологического надзора за COVID-19

25 сотрудников Института прошли повышение квалификации по теме «Актуальные проблемы микробиологии. Безопасность работы с возбудителями III–IV групп патогенности» (72 часа) с углубленным изучением эпидемиологических, иммунологических и др. аспектов, касающихся новой короновирусной инфекции COVID-19.

Шесть сотрудников получили дополнительной профессиональное образование в системе непрерывного медицинского образования (НМО) в виде краткосрочных on-line курсов (18 часов) по клиническим аспектам COVID-19, получены сертификаты.

Было организовано регулярное информирование всех научных сотрудников института современным методическим рекомендациям, инструкциям и распоряжениям службы Роспотребнадзора по актуальным аспектам профилактики, диагностики и эпидемиологии COVID-19.

Была разработана и утверждена Ученым Советом Института программа дополнительного профессионального образования (повышение квалификации в виде стажировки на рабочем месте) «Индикация бактериальных и вирусных патогенов – возбудителей инфекционных болезней человека методом ПЦР” (18 часов). Информация о возможной стажировке была разослана всем заинтересованным организациям ПФО.

Участие в проекте по оценке популяционного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2

С 23.06.2020г. Институт участвовал в реализации проекта об оценке популяционного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 у населения Нижегородской области. Исследования на наличие антител к вирусу SARS-CoV-2 выполняли методом ИФА. Исследование выполнялось в несколько этапов (2020–2021 гг.).

В рамках проекта было проведено 8 036 исследований сывороток крови волонтеров возрастных групп с 1 года до 98 лет. Был показан рост иммунной прослойки среди населения от 8,5 % (на первом этапе) до 66,2 % (на четвертом этапе), из числа обследованных лиц на пятом этапе – 38,3 % респондентов имели антитела класса G к нуклеокапсиду вируса SARS-CoV-2.

Научно-исследовательская работа

• В рамках Отраслевой научно-исследовательской программы Роспотребнадзора в институте проводились исследования по получению комбинированной кандидатной мукозальной вакцины для профилактики новой коронавирусной и норовирусной инфекций. В качестве универсальной технологической платформы для построения разнообразных антигенных композиций в составе вирусоподобных частиц, применяли рекомбинантный норовирусный белок VP1, полученный авторами с использованием изолята норовируса, циркулирующего на территории РФ.
• В рамках Отраслевой научно-исследовательской программы Роспотребнадзора выполнены исследования по разработке прототипа ДНК-биочипа для параллельной индикации актуальных возбудителей внебольничных пневмоний, включая широкий спектр бактериальных и вирусных патогенов, в том числе SARS-CoV-2. Биочип представляет собой экспресс-тест, который выглядит как небольшая пластина размером 25х75 мм. на пластине искусственно синтезированы короткие олигонуклеотидные зонды, позволяющие определять «генетический портрет» возбудителей внебольничных пневмоний.
• Была выполнена совместная работа ФБУН ННИИЭМ им.академика И.Н.Блохиной Роспотребнадзора и ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора (г. Новосибирск) по изучению противовирусной активности производственно-перспективных пробиотических штаммов лактобацилл, выделенных от здоровых людей различных возрастных групп, из коллекции Нижегородского НИИЭМ против рота-, норовирусов, высоко патогенных вирусов гриппа и различных геновариантов вируса SARS-CoV-2. Содержащие эти штаммы лекарственные средства и БАД к пище были предложены для использования в комплексных программах лечения и реабилитации больных с вирусными инфекциями.