В институте разработана программа подбора нуклеотидных последовательностей зондов
Print version |
31 08.2016
Программа для ЭВМ "Splice variants microarray design pipeline (SVMD pipeline)" прошла процедуру государственной регистрации в РОСПАТЕНТ и внесена в Реестр программ для ЭВМ под регистрационным номером 2016619043 от 11.08.2016.
|
Сотрудниками института разработана программа для подбора нуклеотидных последовательностей зондов, используемых для детекции целевых мРНК в пробе с использованием технологии мРНК биочипов.
"SVMD pipeline" обладает следующим функционалом:
1. Проверка термодинамических свойств зондов.
2. Проверка зондов на отсутствие гибридизации с примесными ДНК и пре-мРНК
3. Проверка зондов на специфичность к изоформам мРНК исследуемых генов
4. Проверка степени «сходства» зондов с изоформами мРНК других генов человека
Программа до известной степени инвариантна относительно характера исходных данных, и может быть с некоторыми доработками применяться для решения достаточно широкого спектра задач, связанных с созданием дизайна биочипов.
